Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCARB2Q14108 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCARB2Q14108 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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