Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CAPSQ13938 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAPSQ13938 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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