Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXOSC2Q13868 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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