Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOFQ13790 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOFQ13790 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms