Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDAP1Q13442 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms