Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SKP2Q13309 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SKP2Q13309 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SKP2Q13309 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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