Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF3Q13114 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRAF3Q13114 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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