Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK2Q13002 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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