Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms