Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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