Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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PTPRJQ12913 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRJQ12913 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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