Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGNL1Q0VF96 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms