Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms