Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms