Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL513123.1-201ENST00000415883 597 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC078899.4-201ENST00000593952 1113 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNB1Q02641 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms