Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2BP78356 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2BP78356 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms