Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVK11-1P61568 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms