Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSCP56915 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSCP56915 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSCP56915 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSCP56915 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSCP56915 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSCP56915 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSCP56915 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSCP56915 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSCP56915 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSCP56915 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms