Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP7P55210 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP7P55210 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP7P55210 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP7P55210 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms