Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFDNP55196 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFDNP55196 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFDNP55196 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms