Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms