Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TTPAP49638 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TTPAP49638 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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