Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIA2P42262 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms