Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPREP23469 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPREP23469 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPREP23469 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPREP23469 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPREP23469 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPREP23469 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPREP23469 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPREP23469 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPREP23469 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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