Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DPA1P20036 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms