Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTPS1P17812 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms