Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN1P12814 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms