Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHGAP10645 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHGAP10645 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHGAP10645 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHGAP10645 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHGAP10645 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHGAP10645 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHGAP10645 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHGAP10645 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms