Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms