Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms