Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXB7P09629 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.3 ms