Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POP4O95707 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POP4O95707 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POP4O95707 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms