Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSPNO60542 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSPNO60542 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms