Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KIAA0556O60303 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms