Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGTAO43765 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGTAO43765 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGTAO43765 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms