Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DENRO43583 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DENRO43583 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DENRO43583 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DENRO43583 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DENRO43583 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DENRO43583 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DENRO43583 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms