Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHMG1C9JSJ3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms