Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN25C9JDP6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms