Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF879B4DU55 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms