Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00587B1AMM8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms