Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM200CA6NKL6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms