Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACOD1A6NK06 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACOD1A6NK06 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms