Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC182A6NF36 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms