Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC162PA2VCL2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms