Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPS28Q9Y2Q9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRPS28Q9Y2Q9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms