Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FBXL4Q9UKA2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXL4Q9UKA2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms