Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms