Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms