Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5BQ9UGL1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms