Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms